از آنجایی‌که حفظ امنيت در کتابخانه‌ها از اصول اوليه هست لذا در همين راستا، کتابخانه دانشگاه سيستان و بلوچستان سامانه کنترل تردد و سيستم دوربين مداربسته که از پیشرفته‌ترین خدمات الکترونيکي در کشور می‌باشد را پیاده‌سازی کرده است. با استفاده از اين سامانه، در هنگام ورود به مرکز ضمن تائيد هويت شخص به‌صورت آنلاين، مکان‌‌هايي که هر عضو مجاز به تردد هست، مشخص می‌شود. با نصب گيت‌هاي کنترل تردد در مسيرهاي عبوري، امکان کنترل تردد افراد غیرمجاز به کتابخانه و يا برخي از اعضاء به اماکن غيرمجاز فراهم مي‌شود. اين بخش رابط كتابخانه مركزي با مركز فناوري اطلاعات دانشگاه بوده و در رفع مشكلات شبکه‌ای كتابخانه با متخصصين كامپيوتر مربوطه همكاري می‌کند.
واحد فناوری اطلاعات كتابخانه كه در طبقه همكف ساختمان قرار دارد داراي تعدادي سيستم رایانه‌ای هست كه دانشجويان بر اساس بخش‌نامه‌های مصوب كتابخانه می‌توانند براي مطالعه متن كامل پایان‌نامه‌ها به اين واحد مراجعه نمايند.